'젤다무쌍: 대재앙의 시대'는 '젤다의 전설: 티어스 오브 더 킹덤'의 먼 과거 시대인 '봉인 전쟁'을 무대로 삼는다. 이를 통해 본편에서 간략하게만 다뤄졌던 고대의 이야기를 풀어낸다. 본작의 배경은 '왕눈'의 핵심 서사인 '봉인 전쟁' 시기다. 하늘에서 내려온 조나우족이 하이리안족과 힘을 합쳐 하이랄 왕국을 건국했으나, 이내 거대한 악이 출현하며 전쟁이 발발한다. 미래에서 시간 이동을 통해 과거로 향한 젤다 공주가 하이랄 초대 왕 라울과 소니아 왕비를 만나, 마왕 가논돌프에 맞서는 이야기가 전개된다

• 젤다무쌍 대재앙의 시대