소울리버 2는 전작과 마찬가지로 주인공인 뱀파이어 라지엘이 자신을 창조했으면서도 파멸로 이끈 케인과 노고스의 세계에 감추어진 비밀을 밝히기 위해 새로운 모험을 떠난다는 내용이다. 노고스의 비밀을 밝히기 위해서 게이머는 물질계와 정신계를 넘나들며 여러 가지 다양한 퍼즐을 풀고 강력한 몬스터와 전투를 벌여야 한다.