'헤일로 4' 는 전작 '헤일로 3' 의 3년 후를 배경으로 한다. 코타나와 함께 버려진 마스터 치프는 어떠한 계기로 인해 동면에서 깨어나게 되고, 멸망 위기에 처한 인류를 구하기 위해 새로운 모험을 시작하게 된다. 코타나는 수명이 다해 가는 AI(인공지능)로, 코타나와 마스터 치프와의 관계 등 다양한 스토리가 진행된다.