‘킬존 머서너리’는 기존 ‘킬존’ 시리즈의 주요한 사건들을 주인공의 시각에서 새롭게 바라보는 식으로 전개된다. 플레이어는 헬가스트를 쫒아내는 와중에 도시에 남아 있는 특정 요인들을 보호하거나, 돌발 상황에 맞서 다양한 작전을 수행하기도 한다. 게임을 진행하다 보면 진영에 상관 없이 어느 쪽이든 돈이 되는 쪽에 속할 수 있으며, 이를 통해 다양한 관점에서 전쟁을 경험할 수 있다.