지구연합은 마스터 치프의 대단한 활약에도 불구하고 결국 커버넌트의 무력 앞에 무너지기 시작한다. 지구는 커버넌트의 손에 함락되고 그들은 아프리카 대륙 어느 곳에 숨겨진 고대 유적을 발견한다. 그곳에서 커버넌트들은 심상치 않은 일을 준비하는데...

번지소프트가 그토록 비밀리 진행했던 헤일로3의 그 실체가 E3에서 조금씩 모습을 드러내고 있다. 2007년에 발매될 것으로 예상되는 헤일로3. 과연 지구와 마스터치프의 운명은 어떻게 될 것일까.